林连玉基金自我期许为“观念领航的公民社会团体”，除了关心华文教育，也从事学术文化、跨族群的工作。林连玉基金自1991年开始，配合每年12月的华教节，举办纪念林连玉先生讲座，历年来邀请到不少知名学者，发表专题演讲，传播进步观念，相信是马来西亚国内维持最久的民间专题讲座。
曾经受邀成为林连玉讲座的主讲学人，包括杨振宁、李远哲、高希均、金耀基、余英时、余光中、王汎森、程介明、朱云汉、何包钢、赵鼎新等国际知名学者。
每年林连玉讲座邀请的主讲嘉宾，都经过一番考虑和过程，也配合当前的学术与社会焦点。2019年是五四运动一百年，在讨论本年度讲座时，林连玉基金学术委员会首先是朝五四课题，特色主讲嘉宾，但拟议人选已接受其他单位邀请，另一人选无法出席。过后学术委员们再提出多位人选，包括研究海外华人、经济、教育等领域的学者，基于各种原因都无法落实。
由于考虑到五四运动本为学生运动，加上台湾、香港和马来西亚等地，近年都有学运和社运兴起的现象，导致有关地区政经生态变化，在这个思路下，就邀请了台湾大学社会学系的何明修教授，前来分享台港和华人世界的社会运动，此过程纯粹出于学术讨论的考量。
学术委员会决定了主讲人选后，按程序向华教节工委会、董事会报告，并相继获得接纳。同时依惯例发函，邀请友好团体参与协办，函件中都清楚说明嘉宾和讲题，一切透明磊落。
过去二十多年来，林连玉讲座的主题都离不开人文、教育与重大社会议题，受邀的嘉宾皆是学养精湛的知名学人，早已是林连玉基金的品牌活动。这项讲座旨在创造一个公开平台，让不同世代的朋友在开放与自由的前提下，展开思辨与激荡，秉持学术无禁区之态度，向来不预设任何立场。
本次讲座虽引起社会关注，但讨论至今议题性质已经失焦和变质，与举办学术讲座的原意完全背离，同时为主讲人增加不必要的干扰。林连玉基金董事会最后决定取消本次讲座。对于本次讲座引发外界一些不实和非关学术的说法，主办单位深感失望和遗憾。但我们重申，儘管当前面对诸种压力和艰难，未来仍然不放弃观念领航的初心。